肺癌易感基因检测及分析方法研究

研究背景

在我国肺癌的发病率和死亡率均据癌症之首^[1]，是常见的肺原发性恶性肿瘤。研究证明，肺癌发病是遗传因素（人体内在因素）和环境因素共同作用的结果。环境因素主要包括：吸烟、空气污染、重金属污染、放射性物质等对人的作用。遗传因素主要是指与肺癌相关的易感基因，这些基因在正常情况下参与细胞分化、细胞迁移、DNA损伤修复、解毒功能等。当其中某些基因功能异常（即携带疾病易感基因），并且人体长期暴露在某些环境因素下，肺癌发生风险则会显著升高。

根据多项PRS相关研究发现，将各项风险因素加权，并考虑更多相关但是效应值（OR值）不太高的SNPs，可以获得更准确的PRS统计结果，评分越高，肺癌遗传风险也越高。

因此，创建适合中国人群肺癌易感基因的有效检测方法和PRS评分系统，尽可能多的纳入肺癌风险相关的SNPs并考虑可量化的环境因素（即吸烟），是降低肺癌发生率行之有效的预测手段。

 

研究方法

使用Fluidigm微流控96.96矩阵芯片，通过4色荧光实现一个反应孔检测2个SNPs，最终实现200以内的遗传性肺癌相关SNPs的检测，达到更加全面的位点覆盖。

建立适用于中国人群的PRS评分系统，并添加可量化的环境因素（即吸烟），获得个体水平的风险评分，为个体疾病预防起到提示的作用。

 

研究成果

通过自主研发，已获得1项实用新型专利授权：一种唾液采集装置，同时已申请1项实用新型专利：基因检测用样本归纳架。

本研究通过大样本量的测试，积累了基于中国人群的大量有价值的肺癌易感基因位点相关数据，随着样本量的增加，OR值通过矫正，使PRS结果更加准确和有效，从而实现自动化分析流程。

本项目研究成果已上市，能够为肺癌高危人群提供详细的风险评估，同时指导他们进行肺癌早筛。

在肺癌研究成果的基础上迁移，目前已成功研发出乳腺癌、胃癌以及结直肠癌的PRS风险评估，对于指导癌症早筛具有重要意义。

参考文献：

[1] Bingfeng Han, Rongshou Zheng, Hongmei Zeng, Shaoming Wang, Kexin Sun, Ru Chen, Li Li, Wenqiang Wei, Jie He, Cancer incidence and mortality in China, 2022, Journal of the National Cancer Center, 2024.